Der Sportunterricht am Gymnasium Burgkunstadt bietet eine breitgefächerte Ausbildung in den klassischen Mannschaftssportarten Basketball, Fußball, Handball und Volleyball sowie in den Einzelsportarten Gerätturnen, Gymnastik und Tanz, Leichtathletik und Schwimmen.
Weiterhin absolvieren alle Schülerinnen und Schüler in der 7. Klasse einen Skikurs und können außerdem Kurse im Badminton, Klettern und Mountainbiken belegen.
Ziel ist es, dass alle Schülerinnen und Schüler nach Durchlaufen ihrer Gymnasialzeit umfassende Anreize für sportliche Bewegungsformen bekommen haben und im besten Fall sogar eine Sportart gefunden haben, die sie über ihre Schulzeit hinaus betreiben möchten. Hat man so eine Sportart für sich entdeckt, kann man dieser in einer der zahlreichen Sportarbeitsgemeinschaften mit benachbarten Vereinen intensiver nachgehen: Badminton beim TV Burgkunstadt, Fußball bei der JFG Kunstadt-Obermain, Gerätturnen beim TV Altenkunstadt und Handball bei der HG Kunstadt.